在遥远的LV-223星球上，工程师种族创造了人类，却计划用致命黑水毁灭地球。考古学家肖博士和团队跟随古老星图来到这颗荒凉星球，发现了巨大的环形飞船和成千上万的石棺。当队员们唤醒一个幸存工程师时，他愤怒地撕碎机器人并大开杀戒。黑水泄露后，异形生物破体而出，疯狂猎杀船员。肖博士发现，工程师并非创造者，而是被更高文明审判的堕落种族。最后，她驾驶飞船冲向工程师的母星，誓要探寻终极真相，但异形早已潜入飞船，开启人类与异形的永恒噩梦。