在末日废土上，露奈目睹家园被变异巨兽摧毁，族人惨死。她背负着复仇的使命，踏上寻找传说中“净化之核”的旅途。途中结识了失忆的机械师凯恩和神秘少女莉莉，三人组队穿越危险区域。露奈发现净化之核其实是上古文明的基因武器，能毁灭所有变异生物，但也会让幸存者失去人性。在凯恩牺牲自我修复装置后，露奈选择摧毁核心，用爱与希望重建文明。最终，废墟上绽放出第一朵花，人类迎来新生。