东京街头，平凡少年林羽意外激活神秘异能，获得与机械生命体共鸣的能力。他与拥有独立意识的机甲“龙牙”结成搭档，得知传说中的东京龙珠散落城市各处，集齐可许下任何愿望。然而，邪恶组织“暗影军团”也觊觎龙珠，派出改造人杀手疯狂追捕。林羽和龙牙在涩谷、浅草等地与敌人激战，逐步发掘龙珠背后隐藏的惊天秘密——它们竟是上古文明封印的灾厄核心。最终决战在东京塔顶爆发，林羽以牺牲异能代价，将龙珠转化为净化能量，拯救了整座城市。